Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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TCOF1Q13428 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TCOF1Q13428 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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