Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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IFT88Q13099 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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IFT88Q13099 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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IFT88Q13099 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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IFT88Q13099 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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IFT88Q13099 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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