Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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