Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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LMOD1P29536 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
LMOD1P29536 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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