Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PTPRMP28827 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRMP28827 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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