Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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