Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms