Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL606760.4-201ENST00000617613 718 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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