Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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