Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCBE1Q6UXH8 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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