Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
C10orf55Q5SWW7 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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