Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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CCDC93Q567U6 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC93Q567U6 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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