Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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