Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CCDC142Q17RM4 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCDC142Q17RM4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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