Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
LAMA3Q16787 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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