Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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