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| RUNX3 | Q13761 | GTF2IP11-201 | ENST00000526931 | 420 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001318.3-202 | ENST00000528876 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMD15-202 | ENST00000533095 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512310.9-201 | ENST00000553311 | 948 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02303-204 | ENST00000555442 | 889 nt | TSL 3 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009554.1-201 | ENST00000559251 | 399 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL290P-201 | ENST00000578661 | 300 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VDAC1P8-204 | ENST00000589489 | 997 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | USP32P2-207 | ENST00000608376 | 253 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC108359.1-201 | ENST00000616451 | 1211 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091932.2-201 | ENST00000623014 | 291 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WISP3-211 | ENST00000639360 | 1026 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC25-212 | ENST00000640944 | 261 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IFIT1-201 | ENST00000371804 | 1880 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF677-201 | ENST00000333952 | 3422 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF845-201 | ENST00000458035 | 4311 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAH14-208 | ENST00000430092 | 13763 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OTOGL-204 | ENST00000547103 | 8032 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01277-201 | ENST00000419957 | 2398 nt | TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFI-202 | ENST00000394635 | 2053 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFC3-202 | ENST00000434425 | 1461 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00616-205 | ENST00000514600 | 2017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASXL3-201 | ENST00000269197 | 11399 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SGO2-201 | ENST00000357799 | 4214 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACE2-201 | ENST00000252519 | 3393 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF81-202 | ENST00000338637 | 7859 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN2A-207 | ENST00000631182 | 8430 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MEIOB-201 | ENST00000325962 | 1694 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAS2L3-203 | ENST00000539410 | 2229 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z98755.1-201 | ENST00000407015 | 1384 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLHL4-201 | ENST00000373114 | 2445 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XPNPEP3-201 | ENST00000357137 | 7988 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C5orf42-201 | ENST00000425232 | 11199 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDC42BPA-204 | ENST00000366767 | 9320 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012358.3-203 | ENST00000366287 | 1110 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP332-201 | ENST00000391063 | 115 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL4A-205 | ENST00000404894 | 840 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114755.2-201 | ENST00000413520 | 361 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL445644.1-201 | ENST00000436524 | 751 nt | TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL731574.1-201 | ENST00000447757 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL137001.1-201 | ENST00000450212 | 199 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPDHP14-201 | ENST00000450472 | 937 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCBP1-AS1-237 | ENST00000452431 | 1194 nt | TSL 4 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.1-201 | ENST00000459157 | 104 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092905.1-201 | ENST00000467527 | 949 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005412.2-201 | ENST00000492004 | 341 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4ATAC18P-201 | ENST00000516179 | 126 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-751P-201 | ENST00000516382 | 101 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021733.2-201 | ENST00000518830 | 497 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC115837.2-201 | ENST00000522127 | 677 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01489-201 | ENST00000542689 | 605 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02402-201 | ENST00000550337 | 1212 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104002.2-201 | ENST00000553919 | 318 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAL1-206 | ENST00000554871 | 632 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161757.4-204 | ENST00000557136 | 834 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016839.1-201 | ENST00000578162 | 867 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPLINC-202 | ENST00000579007 | 643 nt | TSL 3 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYLK-221 | ENST00000583087 | 678 nt | TSL 4 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5096-201 | ENST00000583713 | 70 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098935.2-201 | ENST00000604222 | 466 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007497.1-201 | ENST00000610421 | 561 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIR6853-201 | ENST00000619642 | 74 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021106.3-201 | ENST00000623925 | 531 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02246-204 | ENST00000625278 | 740 nt | TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001153.1-201 | ENST00000641024 | 338 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC239809.3-214 | ENST00000496508 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF790-201 | ENST00000356725 | 3037 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZC3H12B-201 | ENST00000338957 | 7256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM196B-201 | ENST00000377365 | 2999 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026951.1-201 | ENST00000559530 | 2459 nt | BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM36-209 | ENST00000514154 | 1952 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092329.3-201 | ENST00000611392 | 1904 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.05 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BICRAL-201 | ENST00000314073 | 6530 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2J3-201 | ENST00000377169 | 1325 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GRID2-208 | ENST00000611049 | 4844 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.3-201 | ENST00000447087 | 1546 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AGO2-201 | ENST00000220592 | 14581 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNF150-202 | ENST00000420921 | 3673 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SUPT3H-203 | ENST00000371460 | 2389 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IKZF2-207 | ENST00000434687 | 3888 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GJA9-202 | ENST00000360786 | 1901 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5-8SP7-201 | ENST00000363443 | 155 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC9B1P4-201 | ENST00000421957 | 1288 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031428.1-201 | ENST00000427154 | 666 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2B7P-201 | ENST00000429302 | 934 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031123.1-201 | ENST00000432823 | 568 nt | TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354863.1-204 | ENST00000436430 | 556 nt | TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450023.3-201 | ENST00000440592 | 271 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP21-3-201 | ENST00000444335 | 253 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157385.1-201 | ENST00000446973 | 268 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365271.1-201 | ENST00000448909 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPT1P12-201 | ENST00000448968 | 492 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |