Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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