Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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