Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
IFT88Q13099 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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