Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms