Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDH17Q12864 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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