Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXO1Q12778 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXO1Q12778 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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