Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
IFFO1Q0D2I5 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms