Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPS29P62273 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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