Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA13P31271 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms