Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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USP18Q9UMW8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
USP18Q9UMW8 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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