Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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