Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms