Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms