Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SCG3Q8WXD2 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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