Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LRIG3Q6UXM1 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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