Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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NDUFA9Q16795 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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NDUFA9Q16795 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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NDUFA9Q16795 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NDUFA9Q16795 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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