Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FXNQ16595 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FXNQ16595 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
FXNQ16595 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FXNQ16595 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms