Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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