Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PUM3Q15397 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PUM3Q15397 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PUM3Q15397 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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