Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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RAB39AQ14964 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
RAB39AQ14964 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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RAB39AQ14964 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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