Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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