Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CACNA1SQ13698 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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