Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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