Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL4BQ13620 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms