Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CUL1Q13616 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms