Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SRSF5Q13243 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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