Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms