Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAF1Q13077 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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TRAF1Q13077 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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TRAF1Q13077 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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