Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
APOBRQ0VD83 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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