Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RASGEF1BQ0VAM2 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms