Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms