Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms