Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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