Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms